El Laboratorio de Biotecnología Ambiental es un centro de investigación, focalizado en el tratamiento biológico de residuales líquidos y sólidos, así como la recuperación de nutrientes como nitrógeno, fósforo y carbono, desempeñando un papel fundamental en la promoción de prácticas sostenibles. A través, de investigaciones pioneras en procesos de digestión anaeróbica, procesos avanzados de oxidación y revalorización de productos de valor agregado, el laboratorio marca una pauta a nivel nacional e internacional en la búsqueda de soluciones para la gestión eficiente de recursos naturales y la mitigación de la contaminación ambiental.

Equipado con tecnología de punta, como un sistema FIA para la medición de nitrógenos en fase líquida, cromatógrafos de gases para la detección de metano y dióxido de carbono, así como equipos para la medición de parámetros estándar de aguas residuales, el laboratorio brinda un entorno propicio para la investigación de alto impacto. Actualmente, alberga proyectos de investigación financiados tales como FONDECYT, FONDEF y proyectos internos, lo que subraya su relevancia y liderazgo en el campo de la biotecnología ambiental.